Mestemacher hat zusätzlich zu den bestehenden Gremien einen Beirat mit Kontroll-, Beratungs- und Genehmigungskompetenzen installiert, der nicht operativ leitet. Neben drei Vertretern aus den Familienstämmen, es sind Fritz Detmers, Albert Detmers und Prof. Dr. Ulrike Detmers, gehören dem Beirat externe Fachleute an. Ins Amt der Vorsitzenden wurde Milagros Caiña-Andree gewählt. Caiña-Andree war langjähriges Mitglied des Vorstands der BMW AG – verantwortlich für Personal- und Sozialwesen, Bau, Energie, Konzernsicherheit und Datenschutz. Zudem bekleidete sie Führungspositionen bei der Deutschen Bahn AG sowie als Mitglied des Vorstands der Vossloh AG. Seit Juli 2020 ist sie Mitglied des Aufsichtsrats der Grupo Antolín, Burgos (Spanien).
Weitere externe Beiratsmitglieder sind der ehemalige Geschäftsführer der Parker Hannifin Deutschland GmbH, Hans Wolf, und der langjährige Steuerberater der Mestemacher-Gruppe, Wolfgang Borkenhagen. Er gehört dem Beirat mit fachlicher Zuständigkeit ohne Stimmrecht an. Nach eigenen Angaben erreicht die Großbäckerei-Gruppe mit der Beiratsgründung die Trennung von Gesellschafter*innengeschäftsführung und Geschäftsführung.
Die Gruppengeschäftsführung besteht zurzeit noch aus Albert Detmers und Prof. Dr. Ulrike Detmers, Kim Folmeg und Marta Glowacka. Albert Detmers übt bis zur Bestellung seines Nachfolgers/seiner Nachfolgerin die Interimsgeschäftsleitung für die Ressorts Vertrieb, Vertriebssteuerung und Vertriebscontrolling sowie Controlling allgemein aus. Mitinhaberin der Backwarengruppe, Prof. Dr. Ulrike Detmers, behält durch Sonderrechte alle operativen Ämter und Funktionen als Geschäftsführerin der Mestemacher Management GmbH.